Non content de veiller aux intérêts de la compagnie, Champlain, dès son arrivée, déploya toute l’ardeur de son zèle pour l’honneur du culte et le progrès des missions. Il se donna une peine infinie pour décider les Hurons à emmener avec eux quelqu’un des Pères qui avaient déjà commencé à instruire leur nation.
A peine la traite finie, il voulut accomplir un vœu qu’il avait fait depuis la prise de Québec par les Anglais. Il érigea, tout près de l’esplanade du fort, à l’endroit où est aujourd’hui le maître autel de Notre-Dame de Québec, une nouvelle chapelle, qui fut appelée Notre-Dame de Recouvrance, tant en mémoire du recouvrement du pays, que parce qu’on y plaça un tableau recouvré d’un naufrage.
Se voyant secondé de plus en plus efficacement par les bonnes dispositions de la compagnie, il entreprit une autre fondation, où l’on se promettait que les missionnaires pourraient faire un grand fruit ; il envoya le sieur La Violette aux Trois-Rivières, pour y établir une habitation et un fort ; ce qui fut commencé le 4 juillet 1634. Le P. le Jeune et le P. Buteux allèrent y résider aussitôt que le logement fut prêt à les recevoir.
Enfin, après avoir donné à sa chère colonie, de nombreux témoignages d’un dévouement sans bornes et d’une piété aussi ardente qu’éclairée, «Champlain, comme dit si bien le P. le Jeune, prit une nouvelle naissance au Ciel le jour même de la naissance de notre Sauveur en terre ;» il mourut le jour de Noël, 25 décembre 1635, aimé et respecté de tous ceux qui l’avaient connu.
