Tant et si bien que les autorités bâloises crurent devoir intervenir en faveur de la paix.
Parmi les publications des dernières années de la vie de Castellion nous mentionnerons son « Conseil à la France désolée » (1562) et la traduction latine des Trente dialogues de Bernardino Ochino, au cours desquels Ochino avait émis l’idée que Moïse n’avait pas interdit absolument la polygamie et que le mariage n’était qu’une institution purement humaine. Ces affirmations provoquèrent un énorme scandale et l’on reprocha vivement à Castellion d’avoir contribué à les répandre. — Castellion est mort le 29 décembre 1563, à l’âge de quarante-huit ans, usé par le travail, par les privations, par les soucis matériels et par les luttes dans lesquelles il s’était engagé avec passion. Il faut rendre hautement hommage au courage chrétien de Castellion, à la noblesse de son idéal de liberté religieuse. Il a eu le mérite très grand d’être, dans un siècle intolérant et persécuteur, la voix de la tolérance, mieux encore la voix de la liberté de conscience. C’est son titre de gloire impérissable.
